Les lacs d'altitude sont principalement alvinés en truites farios, arc-en-ciel et saumons de fontaine, espèces propices à la pratique de la pêche à la mouche.
Les rivières comme le Guil, l' Aigue Agnelle dans les Hautes-Alpes ou en Savoie la Bielle, le Chéran sont aussi des petits paradis pour la pêche à la mouche.